Mužský pohlavní systém se skládá z vnější i vnitřní části. Vnější mužské genitálie zahrnují penis, močovou trubici a šourek. Vnitřní mužské genitálie zahrnují semenný váček, varlata, vas deferens, nadvarlete, prostatu, bulbourethrální žlázu a ejakulační kanál.
Penis je hlavní částí vnějších mužských genitálií, které mají sexuální i tělesné funkce. Je schopen ejakulovat sperma (obsahující spermie) během sexu a zbavit tělo moči. Močová trubice transportuje moč z močového měchýře ven z mužského těla. Semeno také cestuje močovou trubicí.
Každý muž má dva šourkové vaky, ve kterých jsou umístěny určité části vnitřních mužských genitálií (nadvarlete, varlata a dolní spermatické šňůry). Varlata jsou nejdůležitější součástí vnitřních mužských pohlavních orgánů, protože vytvářejí a ukládají spermie a zásobují mužské tělo hormony, které řídí vývoj mužských vlastností a reprodukčních orgánů.
Epididymis ukládá, dospívá a transportuje spermie mezi varlata a vas deferens, což vede spermie k močové trubici. Semenné váčky sousedí s močovou trubicí a vylučují mléčnou tekutinu, která je nakonec vypouštěna ejakulačním kanálem. Bulbourethrální žlázy také pomáhají při vypouštění spermatu.