Z maxilární tepny se zadní hluboká temporální tepna pohybuje vzhůru a prochází mezi vnějším pterygoidním svalem, svalem v čelisti a spánkovým svalem, který je na straně hlavy. V infratemporální fosse (prostor, který leží za lícní kostí) se tepna odděluje do mnoha větví. Infratemporální fossa, kromě hluboké temporální tepny, obsahuje temporální sval, auriculotemporální nerv, hluboké temporální nervy a povrchovou tepnu.
Ve fosse se zadní hluboká temporální tepna pohybuje do spánkového svalu spolu s hlubokým spánkovým nervem. Tepna dodává krev do dlaždicové části spánkové kosti (umístěné nahoře, pokud je spánková kost) a do perikrania (vnější obal lebky), jakož i spánkového svalu. Spojuje se se středními a povrchními spánkovými tepnami a přední hlubokou spánkovou tepnou.